প্রধান অন্যান্য টীকাযুক্ত মানব জিনোম ডেটাবেস আপডেট করা হয়েছে
অন্যান্য

টীকাযুক্ত মানব জিনোম ডেটাবেস আপডেট করা হয়েছে

খবরট্যাবলেট এস অক্টোবর 10, 2001 বিকাল 5:00 PDT

ল্যাববুক তাদের OSU হিউম্যান জিনোম ডেটাবেস (OHGD) এর সংস্করণ 2.0 প্রকাশ করেছে, যা ব্যবহারকারীদের ক্রোমোসোমাল অবস্থান, ফাংশন, এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, রোগ চিহ্নিতকারী সহ বিভিন্ন মার্কার, জিন অন্টোলজি মানদণ্ড, অ্যাক্সেসের নাম বা আইডি এবং রোগের ফিনোটাইপ দ্বারা মানব জিনোম অনুসন্ধান করতে দেয়।

ল্যাববুক হল বায়োটেকনোলজি, ফার্মাসিউটিক্যাল এবং একাডেমিক জীবন বিজ্ঞান গবেষকদের জন্য XML-চালিত জীবন বিজ্ঞান তথ্য এবং তথ্য প্রদানকারী। ডাটাবেস এবং এর সাথে সম্পর্কিত অনুসন্ধান এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুলগুলি eLabBook-এর জিনোমিক স্যুটের মাধ্যমে অ্যাক্সেসযোগ্য এবং সম্পূর্ণ ডাটাবেস এবং ক্যোয়ারী সিস্টেম অন-সাইট ইনস্টলেশনের জন্য লাইসেন্স করা যেতে পারে। সম্পূর্ণরূপে জাভাতে লেখা, অনুসন্ধান এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুল ম্যাক ওএস এক্স সহ বিভিন্ন প্ল্যাটফর্মের জন্য উপলব্ধ।

OHGD-এর মূল অংশে অন্তর্নিহিত মানব জিনোম ড্রাফ্ট সিকোয়েন্স ডেটা এবং ল্যাববুকের মালিকানাধীন EST অ্যাসেম্বলেজ রয়েছে, যার ফলে ইউনিজিনে পাওয়া ট্রান্সক্রিপ্টগুলি 1.7 গুণ বড়, ল্যাববুকের ব্যবসা উন্নয়নের সিনিয়র ভাইস প্রেসিডেন্ট ডঃ অ্যাডেল মিখাইলের মতে। এগুলি মানব জিনোম খসড়া বরাবর প্রায় 70,000 মানব প্রতিলিপিগুলির আরও সুনির্দিষ্ট অবস্থানের অনুমতি দেয়, তিনি বলেছিলেন। LabBook-এর মালিকানাধীন EST সমাবেশ সিস্টেমটি 31,000টিরও বেশি মাউস ট্রান্সক্রিপ্ট পুনর্গঠনের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল যা মানব জিনোম খসড়াতে অবস্থান করা হয়েছিল যা মানব সিডিএনএ লাইব্রেরিতে দেখা যায় না এমন সমজাতীয় মানব জিনগুলি আবিষ্কার করার অনুমতি দেয়।



OHGD 2.0 টীকা PFAM ডোমেন এবং Unigene এবং SAGE এক্সপ্রেশন তথ্যের পাশাপাশি 70,000 টিরও বেশি মানব প্রতিলিপির ক্রস-রেফারেন্সিং অন্তর্ভুক্ত করে। মানব জিনোমের খসড়ার LabBook-এর টীকাতে EBI হিউম্যান প্রোটিওমের ম্যাপিং সেইসাথে ফ্রুট ফ্লাই, নেমাটোড, ইস্ট, এবং ই. কোলি প্রোটিওম এবং ল্যাববুকের মালিকানাধীন মাউস এবং ইঁদুর ইএসটি মানব জিনোমে যোগ করা অন্তর্ভুক্ত।

এছাড়াও অন্তর্ভুক্ত রয়েছে 17,000টি পরিচিত জিন Refseq থেকে intron/exon স্ট্রাকচার ম্যাপিং, 1.3 মিলিয়ন SNPs এবং 75,000 এর বেশি সাইটোজেনেটিক মার্কার। মানব জিনোম খসড়ার ল্যাববুকের বিশ্লেষণে ক্রম পুনরাবৃত্তি এবং CpG দ্বীপের সংকল্পের পাশাপাশি দুটি পৃথক জিন পূর্বাভাস অ্যালগরিদম দিয়ে তৈরি জিন ভবিষ্যদ্বাণী অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।